우리나라 부가가치세법은 전단계세액공제법을 채택하고 있으므로 부가가치세 납부세액을 간접적으로 계산한다. 먼저 해당 과세기간의 재화와 용역의 공급가액을 합하여 과세표준을 계산하고, 그 과세표준에 세율(10% 또는 0%)을 곱하여 매출세액을 계산하며, 매출세액에서 매입세액을 빼서 납부세액을 계산한다. 납부세액에서 경감공제세액, 예정신고미환급세액 및 예정고지세액, 사업양수자의 대리납부 기납부세액, 매입자 납부특례 기납부세액을 빼고, 가산세를 더하면 차가감납부할 세액이 된다.