제목 사업소득이없는비영리법인의 자산양도소득 신고
저자 국세청 등록일 2017.03.08
:::: 세무 ::::
사업소득 없는 비영리법인의 자산양도소득 신고
『제조업, 도ㆍ소매업 등 사업소득이 없는 비영리내국법인』이 부동산 및 주식 등을 양도한 경우 자산양도소득에 대하여
① 각 사업연도소득에 대한 법인세로 신고납부하거나
② 소득세법의 규정을 준용하여 계산한 양도소득세 상당액을 법인세로 납부할 수 있습니다.

→ ①과 ②중에서 선택 적용
특례 적용대상 (소득세법 양도소득세 규정 준용)
제조업, 도.소매업 등 「법인세법」제3조 제2항 제1호의 사업소득이 없는 비영리내국법인이 아래의 자산을 양도한 경우 비영리법인의 납세절차를 간소화하기 위하여 개인과 같은 수준의 양도소득세만을 부담할 수 있도록 하고 있습니다.(「법인세법」제62조의2)
① 주식 또는 출자지분(양도소득세 과세대상이 되는 주식 한정)
 - 주권상장법인의 주식 중 대주주 양도분과 장외양도분, 비상장주식(「소득세법」제94조 ① 3호)
 - 특정시설물이용권부 주식(「소득세법」제94조 ① 4호 나목)
 - 특정주식, 부동산과다보유법인의 주식(「소득세법 시행령」제158조 ① 1호 및 5호)
② 토지 또는 건물
③ 부동산을 취득할 수 있는 권리, 영업권 등(「소득세법」제94조 ①2호 및 4호)

자산양도소득에 대한 과세특례는 자산의 양도일이 속하는 각 사업연도 단위별로 적용하여야 합니다.

사업연도에 양도한 자산 중 일부만 특례를 적용할 수는 없습니다.

고정자산 처분일 현재 소급하여 3년이상 계속하여 법령 또는 정관에 규정된 고유목적사업(「법인세법시행령」제2조 ① 수익사업제외)에 직접 사용한 고정자산의 처분으로 인하여 생기는 수입은 법인세 과세대상이 아닙니다.
과세표준 및 세액의 계산
과세특례를 선택하는 경우 개인의 양도소득 계산 규정을 준용하여 법인세를 계산합니다.

양도차익 : 양도가액 - 취득가액 - 자본적지출액 - 양도비
과세표준 : 양도차익 - 장기보유특별공제 - 양도소득기본공제
산출세액 : 과세표준 × 양도소득세 세율
취득가액 특례
출연받은 재산을 3년 이내에 양도하는 경우
-「상속세 및 증여세법」에 의하여 상속세ㆍ증여세 과세가액에 산입되지 아니한 재산을 출연받은 비영리법인이 당해 자산을 출연받은 날부터 3년 이내에 양도하는 경우에는 그 자산을 출연한 자의 취득가액을 당해 법인의 취득가액으로 합니다.
- 다만, 1년 이상 다음에 해당하는 사업(의료업 외에 「법인세법시행령」제2조 ① 수익사업제외)에 직접 사용한 자산은 그러하지 아니합니다.

① 법령에서 직접 사업을 정한 경우에는 그 법령에 규정된 사업
② 행정관청으로부터 인가ㆍ허가 등을 받은 경우에는 그 인가ㆍ허가 등을 받은 사업
③ 법인등기부상 목적사업으로 정하여진 사업  
신고납부 절차  
「소득세법」제105조 내지 제107조 규정을 준용하여 양도소득 과세표준 예정신고 및 자진납부를 하여야 합니다.
 - 이 경우 소득세법상 서식이 아닌 법인세법시행규칙 서식에 의하여 신고하여야 합니다

양도소득과세표준 예정신고기한 : 양도일이 속하는 달의 말일부터 2월
예외) 주권상장법인의 주식 중 대주주 양도분과 장외양도분, 비상장주식은 양도일이 속하는 분기의 말일부터 2월

○양도소득 과세표준 예정신고를 한 경우에도 확정신고를 요하는 경우*에는 법인세 과세표준 신고를 하여야 합니다.(「법인세법」제62조의2⑧단서)
* 당해 연도에 누진세율의 적용대상 자산에 대한 예정신고를 2회 이상 한 자가 이미 신고한 양도소득금액을 합산하여 신고하지 아니한 경우 등

○ 비영리내국법인이 양도소득과세표준 예정신고 및 자진납부를 한 경우에도 「법인세법」제60조 제1항의 규정에 의하여 과세표준 신고를 할 수 있습니다.
- 이 경우 예정신고납부세액은 기납부세액으로 보아 납부할 세액에서 공제합니다.
신고시 제출할 서류
비영리내국법인의 양도소득과세표준예정신고서[별지 제57호의2 서식]

< 신고서에 첨부하는 구비서류 >
① 양도소득금액계산명세서 1부(별지 제57호의 2 부표서식)
② 양도자산의 등기ㆍ등록관련 서류 1부
③ 매매계약서 필요경비 증명서류 각 1부
④ 감면신청서 1부
⑤ 토지초과이득세의 부과사실을 확인할 수 있는 서류 1부